Après le succès de Belle et Sébastien, près de trois millions d'entrées et 50000 exemplaires vendus tous formats confondus, un deuxième film met en scène les mêmes personnages au lendemain de la Seconde Guerre mondiale.
La Seconde Guerre mondiale est terminée. 
Sébastien a dix ans. Belle et lui attendent impatiemment le retour d'Angelina, qui est comme une mère pour le jeune orphelin. 
Mais Angelina ne revient pas. Son avion s'est écrasé, au cœur des forêts transalpines. 
Tout le village a perdu espoir. Tout le village, sauf César : le grand-père de Sébastien connaît un homme, un pilote du nom de Pierre, qui pourrait les aider à retrouver Angelina.
Pour sauver la jeune femme, l'enfant et son chien, passagers clandestins de l'avion de Pierre, vont devoir braver mille dangers, traverser mille épreuves, et affronter un secret. Un secret qui va changer la vie de Belle et de Sébastien à tout jamais. Car après avoir appris qu'il ne verrait jamais sa mère, Sébastien va enfin retrouver son père. 
L'aventure continue...